Intermolekulární rozpoznávání proteinů a nukleových kyselin

prof. Ing. Bohdan Schneider, CSc., DSc — Vedoucí projektu

Biotechnologický ústav AV ČR

O nás

Projekt je zaměřen na studium interakcí a rozpoznávání biomolekul - především proteinů a nukleových kyselin - na rozlišení jejich specifických a nespecifických interakcí a studium možností cílené modifikace specificity nebo afinity těchto interakcí. Projekt je provázán s projektem Strukturní bioinformatika proteinů, studovány jsou především proteiny imunitního systému, zejména cytokiny.

Cíle:

Vysvětlení specificity interakce proteinů a DNA pomocí analýzy termodynamických, kinetických a strukturních dat
Modifikace interakčních partnerů vedoucí k cílené změně afinity a specificity tvorby biomolekulárních komplexů

Více informací o laboratoři na stránkách Laboratoře (anglicky) a Biotechnologického ústavu

Aktuality

Členové Mezinárodní vědecké rady BTU AV ČR se sešli k hodnocení činnosti ústavu a možnosti jeho dalšího rozvoje

Ve vědě stereotyp nehrozí. Baví mě práce v týmu.

FEBS Practical Course "Hydrodynamic and thermodynamic analysis of biological macromolecules and their interactions"

Být v Izraeli vědcem je prestižní záležitost, ale vybavení máme lepší, říkají čeští vědci ve Weizmannově institutu

Publikace

2015

Jiri Cerny, Lada Biedermannova, Pavel Mikulecky, Jiri Zahradnik, Tatsiana Charnavets, Peter Sebo & Bohdan Schneider: Redesigning protein cavities as a strategy for increasing affinity in protein-protein interaction. Interferon-Îł receptor 1 as a model. BioMed Research International 2015: 716945 (2015). doi: 10.1155/2015/716945.

Tatsiana Charnavets, Jaroslav Nunvar, Iva Necasova, Jens Voelker, Kenneth J. Breslauer & Bohdan Schneider: Conformational Diversity of Single-stranded DNA from Bacterial Repetitive Extragenic Palindromes: Implications for the DNA Recognition Elements of Transposases. Biopolymers, in press (2015). doi: 10.1002/bip.22666.

2014

Bohdan Schneider, Jean-Christophe Gelly, Alexandre G. de Brevern & Jiri Cerny: Local dynamics of proteins and DNA evaluated from crystallographic B-factors. Acta Crystallographica D 70: 2413 (2014). doi:10.1107/S1399004714014631.

Bohdan Schneider, Jiri Cerny, Daniel Svozil, Petr Cech, Jean-Christophe Gelly & Alexandre G. de Brevern: Bioinformatic analysis of the protein/DNA interface. Nucleic Acids Res. 42, 3381-3394 (2014). doi: 10.1093/nar/gkt1273.

Tým

prof. Ing.
Bohdan Schneider, CSc., DSc

ředitel, Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.,
vedoucí výzkumného programu Strukturní biologie a proteinové inženýrství,
vedoucí skupiny Intermolekulární rozpoznávání proteinů a nukleových kyselin

bohdan.schneider@ibt.cas.cz
+420325873701