V Biotechnologickém ústavu AV ČR, v. v. i., vede Laboratoř strukturní biologie, kde se zabývá výzkumem vztahů mezi strukturou a funkcí medicínsky relevantních proteinů.
Hlavním cílem výzkumných studií je enzym glutamát karboxypeptidasa II (GCPII), který slouží jako marker pevných nádorů, zejména nádorů rakoviny prostaty. S využitím biofyzikálních metod (např. rentgenostrukturní analýzy), ve spolupráci s předními světovými pracovišti (Johns Hopkins Medical Institutions, USA; Yale university, USA), se snaží porozumět fungování tohoto proteinu na molekulární úrovni a zároveň detailně popsat interakce s nízkomolekulárními sloučeninami. Výsledky výzkumu mohou být využity např. pro návrh a optimalizaci sloučenin sloužících k detekci nádorů, jakož i k léčbě neurodegenerativních onemocnění. Vysokou úroveň tohoto výzkumu v českém i evropském měřítku dokumentují i prestižní ocenění (EMBO Installation grant a stipendium J. E. Purkyně), která byla udělena dr. Bařinkovi v roce 2010.
Profil skupiny (mateřská instituce): Laboratoř strukturní biologie (BTÚ AVČR)