Laboratoř proteomiky kmenových buněk

RNDr. Kristýna Pimková, Ph.D. — Vedoucí projektu

1. lékařská fakulta Univerzity Karlovy

O nás

Léčba onko-hematologických onemocnění je často komplikovaná vývojem rezistence. Buňky, které léčivu odolávají jsou příčinou agresivního relapsu. Co jsou tyto buňky zač a jak získávají vlastnosti, které jim umožňují překonávat toxicitu léků, zůstává nejasné. Eliminace těchto rezistentních leukemických buněk je jednou z největších výzev v terapii akutní myeloidní leukemie.

Naše laboratoř se zabývá základním a translačním výzkumem toho, jak redoxní metabolismus ovlivňuje dynamiku proteomu leukemických buněk a jejich odpověď na chemoterapii. Zejména nás zajímá, jak změny v redoxním prostředí ovlivňují funkci proteinů a jejich lokalizaci. Využíváme proteomické přístupy založené na hmotnostní spektrometrii a kombinujeme tyto nástroje s biochemickými, buněčně biologickými a genetickými přístupy, abychom pochopili, jak oxidační modifikace proteinů ovlivňují funkci proteinů a regulují základní biologické procesy podílející se na vývoji rezistence.

Aktuality

Krevní kmenové buňky využívají chromatin-remodelační faktory ve specifických procesech: příběh o Smarca5

Vědci z 1. LF UK a BIOCEV získali šest grantů od GAČR!

Oxidace bílkovin: další regulační vrstva při vývoji krevních kmenových buněk

Publikace

2024

Astapenko D, Vajrychova M, Fabrik I, Kupcik R, Pimkova K, Tambor V, Radochova V, Cerny V. Impact of anesthetics on rat hippocampus and neocortex: A comprehensive proteomic study based on label-free mass spectrometry. Heliyon. 2024 Mar 5;10(6):e27638. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e27638. (IF 4.0)

Turkova T, Kokavec J, Zikmund T, Dibus N, Pimkova K, Nemec D, Holeckova M, Ruskova L, Sedlacek R, Cermak L, Stopka T. Differential requirements for Smarca5 expression during hematopoietic stem cell commitment. Commun Biol. 2024 Feb 29;7(1):244. doi: 10.1038/s42003-024-05917-z. (IF 5.9)

2023

Vajrychova M, Salovska B, Pimkova K, Fabrik I, Hodny Z. SILAC-IodoTMT for Assessment of the Cellular Proteome and Its Redox Status. Methods Mol Biol. 2023;2603:259-268. doi: 10.1007/978-1-0716-2863-8_21.

2022

Pimkova K, Jassinskaja M, Munita R, Ciesla M, Guzzi N, Cao Thi Ngoc P, Vajrychova M, Johansson E, Bellodi C, Hansson J. Quantitative analysis of redox proteome reveals oxidation-sensitive protein thiols acting in fundamental processes of developmental hematopoiesis. Redox Biology. Volume 53, July 2022, 102343. ISSN 2213-2317. https://doi.org/10.1016/j.redox.2022.102343. (IF 11.79)

Salovska B, Kondelova A, Pimkova K, Liblova Z, Pribyl M, Fabrik I, Bartek J, Vajrychova M, Hodny Z. Peroxiredoxin 6 protects irradiated cells from oxidative stress and shapes their senescence-associated cytokine landscape. Redox Biol. 2022 Feb;49:102212. doi: 10.1016/j.redox.2021.102212. (IF 11.79)