Klinická proteomika

Klinická proteomika

Doc. RNDr. Jiří Petrák, Ph.D.

Doc. RNDr. Jiří Petrák, Ph.D. — Vedoucí projektu

O nás

Proteom představuje kompletní sadu bílkovin, které se v daný okamžik nacházejí v organismu, tkání či buňce. Proteomika usiluje o kvantitativní i kvalitativní popis proteomů a jejich fyziologických i patologických změn. 

Nejmodernější proteomické postupy umožňují detekci a relativní kvantifikaci až 10 000 bílkovin v jediném experimentu a otevírají tak cestu k popisu mnohých fyziologických a patologických procesů na molekulární úrovni. Právě s pomocí proteomických nástrojů – účinných elektroforetických a chromatografických separačních metod kombinovaných s hmotnostní spektrometrií – se náš tým pokouší popisovat molekulární mechanismy závažných onemocnění a vyhledávat klinicky využitelné biomarkery. 

Aktuální projekty:

  • Studium změn v nádorových buňkách spojených s rezistencí na chemoterapii.
  • Studium molekulárních procesů spojených se srdečním selháním
  • Vývoj nových přístupů k proteomické analýze transmembránových proteinů.

Další informace najdete v angličtině na stránce www.phenogenomics.cz nebo na stránkách http://biocev.lf1.cuni.cz

Publikace

2015

Lorkova L, Scigelova M, Arrey TN, Vit O, Pospisilova J, Doktorova E, Klanova M, Alam M, Vockova P, Maswabi B, Klener P Jr, Petrak J. Detailed Functional and Proteomic Characterization of Fludarabine Resistance in Mantle Cell Lymphoma Cells.. PLoS One. 2015 Aug 18;10(8):e0135314.

2014

Klanova M, Lorkova L, Vit O, Maswabi B, Molinsky J, Pospisilova J, Vockova P, Mavis C, Lateckova L, Kulvait V, Vejmelkova D, Jaksa R, Hernandez F, Trneny M,Vokurka M, Petrak J, Klener P Jr. Downregulation of deoxycytidine kinase in cytarabine-resistant mantle cell lymphoma cells confers cross-resistance to nucleoside analogs gemcitabine, fludarabine and cladribine, but not to other classes of anti-lymphoma agents.. Mol Cancer. 2014 Jun 27;13:159.

2012

Lorkova L, Pospisilova J, Lacheta J, Leahomschi S, Zivny J, Cibula D, Zivny J, Petrak J. Decreased concentrations of retinol-binding protein 4 in sera of epithelial ovarian cancer patients: a potential biomarker identified by proteomics.. Oncol Rep. 2012 Feb;27(2):318-24.)

2011

Petrak J, Pospisilova J, Sedinova M, Jedelsky P, Lorkova L, Vit O, Kolar M, Strnad H, Benes J, Sedmera D, Cervenka L, Melenovsky V. Proteomic and transcriptomic analysis of heart failure due to volume overload in a rat aorto-caval fistula model provides support for new potential therapeutic targets – monoamine oxidase A and transglutaminase 2. Proteome Sci.2011 Nov 11;9(1):69).

Tým

Doc. RNDr. Jiří Petrák, Ph.D.

Doc. RNDr.
Jiří Petrák, Ph.D.

Vedoucí skupiny Klinická proteomika

jiri.petrak@lf1.cuni.cz
+420325873011

Mgr.
Ondřej Vít, Ph.D.

ondrej.vit@lf1.cuni.cz
+420325873010