BIOCEV má velmi dobré předpoklady pro intenzivní zahraniční spolupráci. Od prosince 2009 je členem celoevropské sítě výzkumných infrastruktur Infrafrontier a během roku 2010 se zapojí i do dalšího konsorcia - do Euro-BioImaging. Obě infrastruktury jsou součástí Evropského strategického fóra pro infrastruktury výzkumu (ESFRI, http://cordis.europa.eu/esfri/), jenž je strategickým nástrojem pro rozvoj výzkumné integrace Evropy a pro posílení její mezinárodní spolupráce. Z pohledu BIOCEV je naprosto zásadní fakt, že koordinátoři národních aktivit v těchto sítích – doc. Sedláček a prof. Hozák – se současně podílejí na přípravě projektu BIOCEV.
Kromě toho jednotlivé výzkumné skupiny spolupracují s významnými partnery v The European Molecular Biology Laboratory (EMBL Heidelberg http://www.embl.de/, EMBL Grenoble http://www.embl-grenoble.fr/), v ústavech Max Planck v Německu (http://www.mpi-cbg.de), s Pasteurovým ústavem (http://www.pasteur.fr) a CNRS ve Francii (http://www.cnrs.fr) a s mnoha dalšími zahraničními institucemi. Svůj zájem o spolupráci s budoucím centrem BIOCEV potvrdili i finské Biocenter Oulu (http://www.biocenter.oulu.fi) a Biocenter Kuopio (http://www.uku.fi), Institute of Experimental Genetics v Německu (součást HelmholtzZentrum München, http://www.helmholtz-muenchen.de/en/ieg/) a vídeňská University of Veterinary Medicine (http://www.vu-wien.ac.at/en/).
Integrace BIOCEV do evropského výzkumného prostoru a vysoká komplementarita a synergie všech částí výzkumného záměru BIOCEV jsou zárukou toho, že se BIOCEV stane významnou křižovatkou vědy v srdci Evropy s potenciálem výrazně ovlivnit poznání a jeho přenos do praktického života, s dopadem na zásadní oblasti lidského života jako jsou např. zdraví nebo životní prostředí.